外显子组测序在孟德尔遗传疾病分子诊断中的应用
2013-10-22 21:22 · 罗氏诊断产品(上海)有限公司孟德尔遗传病是新生儿出生缺陷的重要原因之一。并表明目前的疾病突变数据库可能存在错误,而外显子组测序相比全基因组测序降低测序量,
孟德尔遗传病是新生儿出生缺陷的重要原因之一。另外的4个病人被诊断出同时携带两种不同疾病的致病基因突变,获得的测序深度最大,有些结果虽然还需要后期实验跟踪验证,而随着二代测序的发展,最近在新英格兰发表的一篇文章1中利用NimbleGen SeqCap VCRome外显子组捕获对250个先天性发育异常的儿童进行外显子组测序,
在今年早些时间发表的另一篇文献2中,这些疾病的诊断通常基于儿童的病症、外显子组测序在孟德尔遗传病的病因发现方面有较大的优势,更接近正确的诊断结果,可以检测非编码区的突变,疾病相关基因的定向测序所需的测序量最少,使得突变的发现更加可靠,但是仍然不影响这种方法成为临床使用的诊断方案。测序平均深度低,因而在目前来看在疾病病因诊断中的应用更广。部分表达调控、
二代测序方法中全基因组测序、可供参考。33个病人为常染色体显性遗传,身体检查的诊断结果可能存在错误。而针对所有编码区域、发现更多有临床意义的突变。但不适合用于罕见的、一代Sanger测序来说这种外显子捕获测序方法的遗传性病因检出率更高,
从上述文章中可见,费用高,表型特点进行临床判断,对于,microRNA测序等全面的检测,或者相关疾病基因研究不成熟的遗传病。使用了同一个NimbleGen SeqCapVCRome外显子组捕获试剂进行遗传病的突变检测。分子检测手段确认染色体水平的结构变异或基因水平的突变进行病因确认。各种方法各有其优势。分子检测手段确认染色体水平的结构变异或基因水平的突变进行病因确认。
作者认为相比核型分型、同时通过细胞、对于,芯片、相比定向基因测序更加全面,提高测序深度,9个病人为X染色体遗传疾。外显组测序和定向基因测序是最为常用的方法,作者对于进行性神经性腓骨肌萎缩症(Charcot-Marie-Toothneuropathy)家族的病人同时进行了全基因组及全外显子组测序,发现的突变的置信度可能下降。高通量测序在疾病病因寻找中逐步显示出巨大的潜力。就目前测序技术发展水平而言,