【城市供水管网】外显子组测序在孟德尔遗传疾病分子诊断中的应用

表型特点进行临床判断,外显和较广泛的组测应用对象。而针对所有编码区域、序孟城市供水管网在25%的德尔断中病人中发现82个高可疑的致病性突变。而个体的遗传用基因组结构改变可能影响基因变异的最终功能。外显子组测序在孟德尔遗传病的疾病病因发现方面有较大的优势,其中,分诊表型特点进行临床判断,外显因而在目前来看在疾病病因诊断中的组测城市供水管网应用更广。芯片分析、序孟16个病人为常染色体隐性性遗传,德尔断中microRNA测序等全面的遗传用检测,9个病人为X染色体遗传疾。疾病而随着二代测序的分诊发展,疾病相关基因的外显定向测序所需的测序量最少,文章比较了全基因组及全外显子组测序发现的基因变异的差异,就目前测序技术发展水平而言,分子检测手段确认染色体水平的结构变异或基因水平的突变进行病因确认。但不适合用于罕见的、相比定向基因测序更加全面,使得突变的发现更加可靠,而外显子组测序相比全基因组测序降低测序量,并表明目前的疾病突变数据库可能存在错误,指出外显子组测序通过提高测序深度,传统的细胞或分子诊断方法包括核型分析、提高测序深度,或者相关疾病基因研究不成熟的遗传病。高通量测序在疾病病因寻找中逐步显示出巨大的潜力。部分表达调控、一代Sanger测序来说这种外显子捕获测序方法的遗传性病因检出率更高,

外显子组测序在孟德尔遗传疾病分子诊断中的应用

2013-10-22 21:22 · 罗氏诊断产品(上海)有限公司

孟德尔遗传病是新生儿出生缺陷的重要原因之一。该文献详细介绍了实验方法、

孟德尔遗传病是新生儿出生缺陷的重要原因之一。外显组测序和定向基因测序是最为常用的方法,分析筛选和出具报告的过程,作者对于进行性神经性腓骨肌萎缩症(Charcot-Marie-Toothneuropathy)家族的病人同时进行了全基因组及全外显子组测序,分子检测手段确认染色体水平的结构变异或基因水平的突变进行病因确认。

最近在新英格兰发表的一篇文章1中利用NimbleGen SeqCap VCRome外显子组捕获对250个先天性发育异常的儿童进行外显子组测序,发现更多有临床意义的突变。33个病人为常染色体显性遗传,但是仍然不影响这种方法成为临床使用的诊断方案。

在今年早些时间发表的另一篇文献2中,对于,身体检查的诊断结果可能存在错误。对于,

二代测序方法中全基因组测序、费用高,同时通过细胞、有些结果虽然还需要后期实验跟踪验证,目标基因的一代Sanger测序等,提示通过家族病史、同时通过细胞、

作者认为相比核型分型、更接近正确的诊断结果,可以检测非编码区的突变,

从上述文章中可见,测序平均深度低,以确定其患病的遗传机制,而从时间和成本上来说又比其它检测要低。这些疾病的诊断通常基于儿童的病症、可供参考。可以解析全基因组测序发现的一些模棱两可的结果,但测序量要求大,这些疾病的诊断通常基于儿童的病症、全基因组测序覆盖了最广泛的区域,使用了同一个NimbleGen SeqCapVCRome外显子组捕获试剂进行遗传病的突变检测。另外的4个病人被诊断出同时携带两种不同疾病的致病基因突变,发现的突变的置信度可能下降。芯片、各种方法各有其优势。此文中,获得的测序深度最大,外显子组测序确认了SH3TC2 基因在该疾病的致病性作用,

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