罗氏即将推出Heat-Seq靶向富集产品,罗氏先进的各推关产分子条码技术、
罗氏称,出新
Heat-Seq的型测序相工作流程包括文库制备但不含测序,
Qiagen推出二代测序专用RNA panel
Qiagen公司宣布推出170多种新型QIAseq Targeted RNA Panels用于基因表达谱分析,罗氏
罗氏、各推关产可以用来进行序列填充和扩增。出新
Burgess说,型测序相
QIAGEN生命科学业务高级副总裁Brad Crutchfield表示,罗氏自来水这些panel为RNA测序提供了独特高效的各推关产从样本制备到数据分析的解决方案,QIAGEN与基因组研究领域的出新多家重要研究机构合作,客户可以从76,000个探针可检测的76,000个SNPs中进行挑选。使用了5,144个探针。使得QIAseq RNA panels具有行业领先的>97%的特异性、
QIASeq panel结合了NGS技术的灵活性、对于基于序列的基因分型方法,因为只有不到90%的MIPs是从开始就起作用的。定制panel可用于检测具有临床或者生物学意义的基因,该全自动化方法具有高通量的特征,以及Ingenuity Pathway Analysis分析软件,同时构建一个大型数据库用于定制panel的探针设计。
在本月初美国佛罗里达州奥兰多举办的AGBT会议上,能够检测60个癌基因,高通量和qPCR的准确性。Heat-Seq技术使用了升级版的MIPs,
就可用于数百个基因的检测分析。Heat-Seq Oncology覆盖了240kb的靶向序列,
Heat-Seq在投入使用初期将只适用于Illumina测序平台,它们将成为NGS研究人员的得力助手。而且因为一些原因该技术没有被广泛地应用。操作简单,MIPs)。但罗氏说,MIPs是一种寡聚核苷酸,Heat-Seq Ultra Oncology Hot Spot则覆盖30kb靶向序列,
Burgess解释说,“我们的QIAseq panel利用分子条形码技术,并且适用于任何二代测序平台。罗氏NimbleGen公司研发部主管Daniel Burgess提到了一些关于新型靶向富集产品的信息,实现全自动化流程
罗氏NimbleGen公司即将发布一款新型应用于NGS的靶向富集产品,包括转化医学和临床研究中的性能。Qiagen各推出新型测序相关产品 2016-02-27 06:00 · brenda
罗氏NimbleGen公司即将发布一款新型应用于NGS的靶向富集产品,
在QIAseq panel的开发过程中,共需要6.5小时,内置内参设置,同样,>95%的均一性以及可检测低至1个RNA拷贝的灵敏度。实现同时分析12~1000个基因,与其他靶向富集系统相比其价格是有竞争力的。其中包括1.5小时上机时间,名为Heat-Seq,然后通过测序检测了其中10,000个。定制panels最多可以包含20,000个探针。和一些用于肿瘤检测、QIAGEN致力于为广大实验室提供从样本制备到数据解读的全面NGS方案。该技术在几十年前已经被发明出来,其双末端与基因组上的靶点进行杂交形成环状,Burgess说,名为Heat-Seq,灵活性强。适用于大规模样本研究。并在大量研究中用于靶向DNA扩增。在最初阶段,这些基因是从相关的医学和科研文献的最新推荐中选出的。先进的NGS文库制备技术,其芯片技术可以使公司在挑选探针前合成大量的探针并进行评估,使得RNA测序更加精准可靠。而且,
哈佛医学院George Church的研究小组2007年发表在《Nature Methods》上的一篇文章中,例如遗传疾病panels可以整合420个孟德尔疾病相关基因,MIPs的使用方法难以开发,每个panel可检测100~500个基因,该技术主要依赖于分子倒位探针(molecularinversion probes,没有任何MIP数据分析的软件,含有53个癌基因的热点区,而且探针的设计也是一大难题,探索基因、进而拓展公司二代测序从样本到结果(Sample to Insight)完整流程的应用范围。为研究提供了真实可靠的数字RNA测序结果和准确的基因表达结果。配套行业领先的RNA分离技术,该产品计划将在第二季度发布。PCR duplicates和扩增偏好性引发的技术难题,可在单个管内进行多个酶促反应步骤。进而拓展公司二代测序从样本到结果完整流程的应用范围。由于每个探针的工作效率不同,MIP文库仍然需要优化。在2月11日的AGBT会议上,解决了探针设计中存在的问题。”
QIAseq Targeted RNA Panel涵盖了大量与疾病和信号通路相关的基因,细胞表型与疾病进程间的相互作用。解决了低丰度转录组、而且NimbleGen公司利用芯片技术,
根据公司透露的情况,MIPs技术都没有商业化,他们利用改良的MIPs技术靶向了55,000个外显子,不需要生物信息学背景即可进行全面的数据分析。美国威尔康乃尔医学院副教授Chris Mason博士是QIAseq Targeted RNA Panels的早期使用者之一,
然而到目前为止,验证了该产品在多种应用中的性能,Chris Mason博士发表了新panel的相关应用数据。
新型的QIAseq Targeted RNA Panels采用创新的分子条形码技术,研究基因表达倍数变化,肿瘤panels可包含多达500个癌症相关基因。使用635个探针。产品具体价格目前尚未公布,QIAseq panels整合了数据分析和解读模块,罗氏将推出两款固定内容的肿瘤panels——Heat-Seq Oncology和Heat-Seq UltraOncology Hot Spot,利用这些panel,研究人员能够从超过20,000个人类基因和lncRNA中选择研究对象,目前罗氏已经开发出分析Heat-Seq富集数据的软件。