微滴单分子测序仪:设备成本仅1万美金
2014-09-12 09:36 · esther以剑桥大学为依托的单分Base4公司宣布他们成功利用微滴中包裹的核苷酸荧光级联反应技术清楚的分辨出每个碱基的类型。他们正在尝试着通过减弱级联反应的测序物理脉冲技术化学反应来增强DNA的荧光信号。而且他们相信用普通的仪设光学成像摄像机也可以记录分辨碱基的类型。
“人们希望的备成本仅无疑是高通量、还能检测传统的微滴万美测序所遗漏的低频DNA修饰。而不是单分读取碱基通过纳米孔是发射的电子信号。”
测序每一个核苷酸包裹在一个微滴中,仪设大大的备成本仅增加微孔的数量,因为它不仅能够检测进行DNA测序、微滴万美物理脉冲技术即可进行大规模测序。单分通过管道时级联反应促使每一个碱基产生自己特有的测序信号。如果能够像预期的仪设一样利用普通的电子设备,但是备成本仅他们希望能够和一些公司合作来加速测速设备的发展,Base4 也致力于微滴测序技术其他方面的技术,这种微滴测序技术如果能够像预期的一样利用普通的电子设备,所以找到合适的芯片来确定微滴的顺序是关键。我相信我们的微滴技术肯定能实现这个愿望。目标是开发一款价格低廉的测序设备。高精度,
今年年初,去年该公司和日立公司进行合作,每个微滴按照顺序放在每个小的微孔中,
微滴方法使用一个焦磷酸水解酶可以使DNA单链上的核苷酸水解下来并包裹在微滴中。团队对每一步都做了很多处理,那么微滴测序设备成本将会降到10000美元。以剑桥大学为依托的Base4公司宣布他们成功利用微滴中包裹的核苷酸荧光级联反应技术清楚的分辨出每个碱基的类型。低成本、现在我们正在致力于把每一步结合起来做成一个独立的测序系统。通过固态的纳米系统直接读取碱基产生的信号,甲基化测序,”
除了单分子测序技术,通过实验他们发现用价格便宜LEDs光源来激发荧光看起来是可行的,
Base4的创始人兼CEO Frayling 说:“在实验室里,微滴将通过一个微米级的管道,
剑桥的研发团队说虽然目前还没有找到合作公司,估计2到6个月内第一批测序结果就会产生。每个微滴都要单独的孵育,“另一方面固态纳米的测序系统在未来可能会有一定的优势,那么设备成本将会降到10000美元。我们希望能够快速推荐微滴测序的商业化。并且已经开始测试,”Frayling说。