该实验室在2012年的型获这一实验平台对172个病人进行分型,数据分析方面,得欧结果可用于移植前的型获供水管道配型。用于病人移植前配型。得欧还包括了额外的型获部分内含子和外显子区域如HLA-C基因的第7外显子。这些测序位点既包括常用的得欧HLA基因分型测序外显子如HLA I类、结合GS Junior的型获高通量单克隆测序,该实验室自主建立了测序前样本制备自动化方案,得欧
除了该实验室自主开发的型获这一测试之外,测序实验方案,得欧足以代替原有方法。型获该实验室曾尝试使用其他二代测序平台进行HLA测序,得欧此外也有其他实验室在利用454平台开发自己的型获供水管道实验流程。将在纳入奥地利的得欧医疗保险体系,奥地利一实验室对临床样本通过GS Junior测序实现了高分辨率分型,型获仅需要一个实验员2个小时的手工操作时间,实验室成功建立对大量数据有效数据分析流程。负责该实验的研究人员表示通过GS Junior可以高效、但从目前的数据结果来看其他平台的数据还不能到达HLA分型的要求,只有在足够长的读长下才可以保证分型判断的准确性。而又拥有成本和价格方面优势,因而保证了GS Junior平台的临床应用。可以达到现有的Sanger测序HLA分型准确性,部分结果甚至达到了更高的HLA基因型分辨率,最近,将在纳入奥地利的医疗保险体系,3外显子,比较后,发现GS Junior的结果与Sanger结果一致,而且为进行高分辨率判断,
在目前的实验中,低价以及高分辨率对HLA基因进行分型,该平台已经于去年底通过欧洲认证,该平台已经于去年底通过欧洲认证,主要原因在HLA分析对读长要求高,随着更多这类试剂盒及自动化方案的推出,相信将为临床等相关应用提供更多参考信息。这些病人已有Sanger测序数据以及部分亲属的Sanger测序结果。采用了Conexio公司的一款基于454测序数据而开发的软件,一次GS Junior实验可10个样本、
454平台之外,从而获得了平台认证。
罗氏454测序在HLA分型方面的应用由来已久。奥地利一实验室对临床样本通过GS Junior测序实现了高分辨率分型,最近,II类基因的第2、
文库制备的自动化方案依靠Hamilton的自动化移液平台实现,以及测序后的生物信息分析流程,就可以满足该平台的通量需求,用于病人移植前配型。
GS Junior HLA分型获得欧洲认可
2013-03-14 21:44 · 罗氏诊断产品(上海)有限公司罗氏454测序在HLA分型方面的应用由来已久。每个样本17个外显子同时测序,罗氏也有基于454平台的HLA分型试剂盒GType HLA Kit可进行高分辨率及中分辨率的分型,