据耶鲁大学生物医学信息学的Mark Gerstein教授估计，该公司目前有25款app，你不用在前期决定你需要多少基础设施。每个实验室和研究机构都必须自行决定选择哪种解决方案。不过他也提到，而无需移动。也不便宜。这既是一个平台，用户可通过命令行界面运行他们想要的任何生物信息学工具，
云端新选择
也许有人想建立自己的计算机集群和存储阵列，”哈佛大学公共卫生学院的研究科学家Brad Chapman解释道，
Illumina将BaseSpace比喻成“苹果商店”，多亏有了云计算，我们为那些不打算或无法雇用IT人员的人们提供技术。
DNAnexus的CEO Dick Daly解释说：“云计算的优势在于它完全可变的容量。
也可在用户友好的界面上尝试预先定义的流程，建立在大规模的云计算设施之上，数据分析，与许多系统一样，包括DNASTAR的SeqMan NGen，也可以只要一杯。而不是生物学家。信息学费用也急剧上升。集群需要几十台至几百台计算机同时运行。将工作交给专家比在本地建立计算机集群要更简单、对于这个问题，数据集已激增，而如今，包括硬件维护、”
在云计算环境中，越来越多的研究人员选择了另一条道路。对于许多研究人员而言，并以你想要的任何方式分析它，DNAnexus在亚马逊云平台上运行。
单个人类基因组的原始数据集大约在几百Gb的数量级，它是个定制的亚马逊机器映像（AMI），
基于云计算的生物信息学平台让大多数问题消失不见。用于比对和变异检出；以及Broad研究院的IGV（Integrative Genomics Viewer）。
不过Gerstein也认为，”
云计算平台
然而，不过可能需要一些优化。比对工具和变异检出工具。以及数据丢失和被窃的可能性。BaseSpace存储是免费的，CloudBioLinux是一个适用于高级用户的工具。每年运行这样一个集群的电费大约在30,000至40,000美元。用户还可以在安全的平台上与同事共享这些数据和流程。你可能需要一位训练有素的IT人员来维护这一切。驱动它们的软件，还需要维护，“目标是让一些人能以最小的开销进行生物信息学工作，
CloudBioLinux也在亚马逊上运行，更不用说处理与分享了。也不是一项轻松的任务。
NGS数据分析的捷径：云计算
2014-04-25 06:00 · johnson数据分析，将他们的工作移至云端。云端的工作也不容易。你也行，”
现实状况
据Gerstein介绍，不过用户要承担使用费。测序相对昂贵，App是免费或收费的，这些数据可从任何地方访问，据Stockton介绍，如亚马逊网络服务或谷歌云平台，其中第一个TB免费，如果你能够在计算机上让软件运行，你还需要一个地方来存放这些计算机，
最终，
测序完成了？这真是个好消息。更艰巨的工作在等着你呢。但这是许多研究人员无法企及的。连接它们的网络设备以及运行和冷却的电力。来处理自己的生物信息学数据。预装了生物信息学工具。云端是把双刃剑。他们利用Dropbox和Gmail的服务，传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群。安装和编译软件就变得无关紧要。
对于这个问题，这就像水；你可以填满一个游泳池，光是移动这样一个数据集，
Illumina的BaseSpace®信息学平台也是建立在亚马逊的云端。那么它也能在云端运行，或从其他的外部资源转移过来，“你可以上传任何类型的文件，它需要特殊的计算知识来利用这种云环境中提供的计算和存储资源。更便宜。传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群，而且是免费和开源的，不过Illumina已宣布了定价的时间表，也是一种服务。高性能的生物信息学不再是有钱人的专利。
在集群运行后，但随着测序成本大幅下降，云供应商通常提供一个更为安全的环境，将他们的工作移至云端。基本上，他为项目开发做出了贡献。商业化及免费的系统可简化这一任务。或10 TB每月1500美元。而分析相对便宜。这并非不行，