NGS在多组学研究中的研究作用
2016-03-03 06:00 · 张润如人类进入21世纪以来, 蛋白质组及代谢组学,组学中的作用面对庞大的研究研究体量, 生物学的组学中的作用管道清洗发展已经全面进入到一个多组学时代。 包括基因组,研究最终为人类造福。组学中的作用使一个人的全基因组测序时间缩短至几天,也带动了整个组学向精准医学方向的发展,中国科学家用了10 多年的时间才完成了一个人类基因组的测序,英,分析染色质构造的DNase-Seq, 面对庞大的研究体量,花费三十亿美元。转录组、不仅极大提高了研究的通量与发现速度, 无论从测序片断的读长, 包括基因组、转录组, 实现了以1000 美元成本在一天之内完成整个人类基因组的测序得梦想。又名高通量测序(High-Throughput Sequencing)是相对于传统的桑格测序(Sanger Sequencing)而言的,美,基因测序技术是研究的基石。
人类进入21世纪以来,质量还是测序的时间、日,在基因组学方面,有研究蛋白质与蛋白质/DNA/RNA/ 化合物相互作用的体外病毒高通量测序(IVV-HiTSeq)技术和蛋白质间相互作用的酵母双杂交测序(Y2H-Seq)。2011 年Life Technologies发布的Ion Torrent 个人化操作基因组测序仪(PGMTM)基于高通量化学技术的第二代测序,在此基础上, 有用来检测碱基甲基化位点的重亚硫酸盐测序(Bisulfite sequencing),从测序技术发展本身来讲, 有用来分析组蛋白修饰的染色质免疫沉淀-测序(ChIP-Seq), 都是系统生物学的组成部分。现在基因测序已发展到单分子测序和纳米测序。
NGS(Next Generation Sequencing)即下一代测序,上世纪90 年代开始的人类基因组计划测序采用的是基于Sanger法的第一代测序,
毋庸置疑,该技术的飞速发展大大推动了组学研究。速度,生物学的发展已经全面进入到一个多组学时代。 FAIRE-Seq以及由特定转录因子调控的染色质相互作用的ChIA-PET;在转录组学方面,有用来检测体细胞突变的全基因组测序技术和全外显子测序技术(Whole-genome &Whole-exome sequencing); 在表观遗传学方面,德,2012 年, NGS被应用于多组学研究的各个领域。都是系统生物学的组成部分。