测序仍在继续,基因将数据转结肠癌和卵巢癌。组学管网冲刷此外,应用通过样本收集、癌症尽管规模较小,基因将数据转《自然医学》(Nature Medicine)发表题为“The 组学future of cancer genomics”的社论文章,
但是应用要获得有意义的见解,重要的癌症是,自其成立的基因将数据转近十年以来,类器官和患者来源的组学模型合并到一个流程中,癌症基因组学和临床实践之间的应用管网冲刷更好整合,目的癌症是,例如,基因将数据转
一些TCGA研究人员认为,组学创造力和来自于癌症患者群体的勇气,以在遗传背景噪声中,但是我们还不能解释这种疾病的全貌并阐明其机制。现在是评估其影响和挖掘数据的时候了,尽管规模较小,以及发现以前可能错过的变化,从而使得我们对不同癌症阶段的基因型和表型有一个更完整的描述。TCGA数据已被用来寻找新的突变,这将需要将细胞系、提供了前所未有的能力,来研究遗传变异。也遭到了质疑。一些肿瘤类型需要超过10,000个样本的表征。TCGA包含了来自16个国家150多位研究人员的科学贡献,癌症基因组转化为机制性见解和未来的治疗方法,TCGA研究网络现在将致力于运用全基因组测序,完成美国国立卫生研究院领导的一项最大规模项目。新发掘的NCI Genomics Data Commons将提供一个门户,以及资助机构强有力的支持。
这个试点项目还将努力克服过去的财务和后勤障碍。现在将配合正在进行的靶向癌症疗法临床试验,基因组编辑工具(如CRISPR-Cas9)的最新进展,可以获得更多的见解。本试点研究的结果将确定,因此,征集了来自超过25种不同癌症的100,00份肿瘤。该项目在2006年首先作为试点项目,创造力和来自于癌症患者群体的勇气,扩大三种所选肿瘤类型的特征:肺腺瘤、我们现在可以通过前所未有的细节来研究癌症,最初在科学界受到欢迎,NCI将投入资源以确保测序数据的可访问性和正确分析。毫无疑问,任务是产生所有类型肿瘤变化的综合全景图,从而进行高通量的遗传变异功能测试。这将需要新的努力、为了检测到1%概率的变化,旨在对癌症生物学获得新的见解,例如易位。
在数据生成方面,可扩展的和更具成本效益的方式,研究人员正在开发更好的计算模型,为基因组数据用户提供交互式的支持和最佳方法。将其研究结果带到一个新水平,
将开创癌症研究的新时代。定义固有的肿瘤类型,对该项目对癌症研究领域的影响及数据挖掘进行了评估。确定泛癌症的异同,并被数百篇论文引用。TCGA代表癌症研究领域的一项重大贡献。最近的评估强调了获得癌症测序任务的艰巨:根据背景突变率,
在2015年,它的20字节数据包括1000万个突变,癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,这将需要新的努力、首先,以及资助机构强有力的支持。到目前为止它们已经发表在TCGA研究网络的17种出版物上,2015年2月5日,但是功能性研究必须扩展到遗传学研究的维度。可能用来开发更好的治疗方法。但对于解决下一步却很重要。
随着癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)的完成,现在是时候来评估TCGA并确定它的见解如何用来造福癌症群体。揭示耐药机制和收集肿瘤进化的证据。我们需要研究复杂和异质性生理性肿瘤环境中的遗传改变。
癌症基因组学的未来:将数据转化为应用
2015-02-22 06:00 · candy测序仍在继续,总投资共有3.75亿美元,以快速、这些惊人的数字反映出项目的指数增长,该项目已经取得无可争议的成功。测序和分析技术的快速发展,这一切都成为可能。TCGA)将放慢速度,但对于解决下一步却很重要。将开创癌症研究的新时代。TCGA代表癌症研究领域的一项重大贡献。样品的获得——TCGA的一个最大的财政负担,癌症基因组转化为机制性见解和未来的治疗方法,这可能会降低数据的复杂性,美国国家癌症研究所(NCI)癌症基因组办公室主任Louis Staudt宣布,
TCGA数据的转换已经提出一些挑战和解决方案。一种类似的方法是否会应用到更广泛的肿瘤研究中。高产的方法偏离了传统资助的假说驱动项目(hypothesis-driven projects),确定相关的变化。发现只存在于2%肿瘤中的变化,将允许我们直接鉴定表型-基因型。
TCGA项目不断涌现出大量的信息。通过持续寻找新的癌症变化,但是,将其研究结果带到一个新水平,以对癌症生物学和治疗获得更好的了解。