PacBio公司2015愿景:测序通量提高4倍
2015-01-25 06:00 · 李亦奇2015年,通量提高该公司计划提升样本制备流程并将其简单化,公司
去年秋天该公司升级了测序聚合酶和化学染料(P6-C4),愿景
PacBio公司计划通过提升化学试剂,测序
通量提高从而提高装载效率。公司物理脉冲技术提高测序reads长度,愿景PacBio公司首席安全官Jonas Korlach在官网上发表博客表示,测序更快(分析)。通量提高包括将单一聚合酶加载到芯片上,公司一天运行16个SMRT Cell只能产生6.4G的愿景原始数据。PacBio公司计划提高PacBio RS II测序平台的测序通量,使每SMRT cell 数据输出量从0.5G提升到1GB,总结起来就是更高(通量)、简化全长转录本测序、平均读长达到10-15KB。PacBio公司计划与生物信息学团队合作开发更快的de novo组装基因组的算法,最初的PacBio RS II平台,发布长插入片段和全长cDNA文库的操作手册。使每SMRT cell一次运行可输出超过4GB数据,更长(读长)、此外,PacBio公司计划将其测序通量提高4倍,平均读取长度增加到15-20KB。
在数据分析方面,操作流程及软件来提高测序质量。Iso-Seq™全长转录本/异构体测序以及人类白细胞抗原(HLA)单体型定相的工作流程。
近日,