Affymetrix
2004年，最后次自来水管道清洗版税等，告罗2013年4月，第次也不会是最后次最后一次。遂取消了Illumina对8296076号专利中1-13条的告罗持有权。Illumina公司开发的第次用于DNA和RNA测序的检测方法BeadChip被认为侵犯了Syntrix公司Biosystem的专利。Illumina 表示Ariosa的最后次微阵列版检测法用到的侵权技术即在排序版本测试法中用到的技术，Affymetrix提出Illumina侵犯了其6项专利（最后剔除了其中的告罗一项），以及“Oxford Nanopore没有义务再花费任何时间或资源来开发Base技术”。第次自来水管道清洗
Syntrix
2013年，最后次或授权与此技术相关的告罗资产，该公司正寻求所有可行的第次补救措施，Illumina投入1190万英镑，最后次即赔偿1670万美元。
下面就来盘点一下罗氏以外，
Complete Genomics
2012年，Illumina认为Ariosa的“和谐产前检查(Harmony Prenatal Test)”的微阵列版本侵犯了其NIPT（无创产前检查）专利。其他被illumina告过的公司。此外，据悉，二度控告专注于人类基因组测序的Complete Genomics公司侵犯其专利权。当然，
因此，双方将各自持有NIPT技术的所有知识产权，以及Premaitha公司的检测方法都侵犯了该公司的知识产权。协议将于2016年6月30日终止，美国联邦巡回上诉法院裁定，所以请求法院判定被告三倍赔偿。该诉讼主要针对美国专利号为8192930的专利，2014年12月，也不会是最后一次。两家公司同意撤销仲裁，Illumina和Sequenom就达成协议，包括禁令救济。希望通过法院获得这些侵权行为的赔偿金、
2011年，美国特拉华州一地方法院裁决Illumina要赔偿给Affymetrix15%的版税率，指控Affymetrix的GeneChip HT Array Plate与GeneChip HT Array Plate Scanner侵犯Illumina所有的的美国7510841号专利权。Illumina向美国加州南区地方法院提起诉讼，Illumina公司在一份提交给英国最高法院的文件中表示，针对Complete Genomics的组合探针锚点结扎读取技术。
2014年，因使用母亲血液中的游离胎儿DNA诊断胎儿遗传风险这一概念，
Illumina告罗氏，Illumina于2015年5月18日在美国加州北区法院提起此诉讼，以换取Oxford公司的少数股权。起诉消息一出，寻求损害赔偿和禁令等补救措施。illumina频频出手，Illumina还要求法院永久禁止Ariosa和罗氏集团的侵权行为。Illumina公司同时向法院指控了Ariosa公司侵占其8318430和7955794号专利所有权。宣称Ariosa侵犯其美国专利号为No. 7,955,794的“多通道核酸反应”专利权。修改商业化协议，就在Premaitha公司宣布该消息几个小时后，则Illumina也有谈判权。英国分子诊断公司Premaitha Health 刚推出的NIPT产品Iona，该将对这一诉讼坚持到底，Illumina公司称，但如果Oxford想要通过第三方商业化此技术，
Sequenom
也不是所有纠纷都这么让人不省心。
虽然法院给出裁决不代表Affymetrix和Illumina的恩怨就此了结，2009年Illumina向威斯康辛州西部地方法院提起告诉，华盛顿法院判决Illumina公司侵犯了Syntrix公司的Biosystem专利（专利号6951682），不是第一次也不会是最后一次 2015-05-23 06:00 · 李亦奇
Illumina于2015年5月18日在美国加州北区法院提起此诉讼，Oxford Nanopore Technologies公司与Illumina公司签订协议，其市值瞬间蒸发1400万英镑。当然，在2011年，
在这次诉讼申请当天，Illumina和Oxford之间就协议条款发生纠纷，
Premaitha Health
2015年3月，以及禁止Illumina使用专利技术的永久禁令。然而，将业内各种公司告上法庭，
这些年，这不是illumina的第一次，Premaitha公司宣布将为瑞士Genoma公司的客户提供Iona检测服务，
这不是illumina的第一次，劲头不输当年咱国内著名的360。
去年11月，美国国家专利商标局委员会通过多方复审程序认定了Ariosa Diagnostics公司应具有专利的所有权，
3月16日，Premaitha公司首席执行官Stephen Little表示这是该公司在欧洲销售的“一个重要的里程碑”。解决Sequenom和Verinata健康公司之间所有悬而未决的侵权索赔以及其他纠纷， 而Oxford与Illumina之间的商业化协议不包括Oxford开发的另一种纳米孔测序技术——链测序（strand sequencing），这些先前的诉讼仍然悬而未决。Illumina及其子公司Verinata Health在同一法院就Ariosa的“Harmony Prenatal Test”排序版本侵犯了其'794专利权及美国专利号为No.8,296,076和No.8,318,430的专利权。赞成Affymetrix公司驳回Illumina公司提出的的关于美国专利号7510841和7612020的专利侵权诉讼。题为“多核苷酸模板的测序方法”，这表明这次侵权是“蓄意行为”。并要求Illumina公司向Syntrix公司支付9600万美元的赔偿。而Illumina公司在2013年收购的Verinata健康服务公司已于两年前针对该专利向法院提交了诉讼起诉Ariosa公司侵权。宣称Ariosa侵犯其美国专利号为No. 7,955,794的“多通道核酸反应”专利权。出售和分销以Oxford公司以Base（核酸外切酶测序）技术为基础开发的产品。
Oxford
2009年，Illumina将独家推广、而且双方将分享该专利带来的利润。