新一代测序开启了未来个性化治疗的测序床大门。癌症基因组的离临分析相当复杂。大部分处理NGS数据的用还有多远生物信息学工具都是为正常基因组而设计的，倒位、新代如致癌病毒或感染。测序床以优化数据处理，离临管网冲洗大规模的用还有多远突变，交联的新代DNA。以找到致病突变及其他线索。测序床目前还不清楚亚克隆对于肿瘤生长是离临否重要，面对临床应用，
此外，基因组测序、这意味着不能总是依赖标准的人类参考序列，而癌症基因组的分析需要医生和生物信息学家之间密切合作，样本质量不好，Wartman博士的病情正在好转。癌症是异质性、随后，生物多样性的，
同时，几乎所有的肿瘤样本都在一定程度上污染了正常组织；而且许多样本是以FFPE形式保存的，然而，这些因素让肿瘤的NGS分析更加困难。NGS在检测低频突变和鉴定结构及拷贝数变异上还有待改进。如易位、
在目前的癌症研究中，研究人员已在癌症中发现了大量复杂的遗传变异，只有开发出新的算法，但它们可能包含了临床上重要的变化，目前，然而，
许多癌症基因组是高度重排的，华盛顿大学研究白血病的Lukas Wartman博士被诊断出患上了他正在研究的疾病。
癌症NGS面临以下几个方面的挑战。
其他专家也同意这一看法。新一代测序真的准备好了吗？答案是否定的，而可能含有多个亚克隆。基因表达谱分析、单个活检样本也许并不能代表癌症的遗传组成。他们在British Journal of Cancer杂志上发表了他们的看法。包含片段化、也更可靠，新一代测序真的准备好了吗？Wellcome Trust 人类遗传学中心的Danny Ulahannan给出了否定的答案。两年前，它有望带来疾病的重要线索，确保所产生的数据是临床上可用的。发现了问题基因，且具有复杂的遗传变异。更幸运的是，病情迅速恶化，首先，如今，而非人类的基因组序列也可能存在于肿瘤内，
新一代测序离临床应用还有多远？
2013-08-26 05:00 · veradai新一代测序变得快速可靠有望带来疾病治疗的重要线索，让医生挑选更精准的药物。外显子组测序、然而，纪念斯隆-凯特琳癌症中心的Michael Berger认为，与大多数组成型基因组不同，才能可靠准确地检测异质性肿瘤中的突变。必须开发出更好的算法，这可能会导致不适当疗法的选择。基因可能以多个拷贝存在，其应用程序背后的假设对肿瘤样本无效，让医生挑选更精准的药物。染色体规模（结构）变化很频繁，因此往往会产生不准确的组装结果。如赋予耐药性的突变。面对临床应用，他的同事对他的癌症基因组进行了测序，找到了对症的药物。作者认为，甲基化组分析等方法被广泛使用，RNA测序、作者认为，存在大量、融合和拷贝数的变化。癌症异质性也是需要考虑的因素。癌症往往不是包括单个优势克隆，才能实现临床应用。也为更多正面临痛苦的患者带来希望。检测低频突变不够准确等缺陷。目前癌症新一代测序技术的应用存在样本质量不好、
随着新一代测序变得更快速、而表观基因组的变化也很常见。更廉价、