其实,可是不管是活检还是尸检都不是医疗实践的最佳选择。还有实验过程中产生的噪音(analytical noise), 比如多聚酶扩增误差,
韩健:研发诊断的创新宝典
2015-11-27 06:00 · 李亦奇诊断,信号几乎永远和噪音共存的,信了错误的信号(把噪音当做信号了)。首先看诊断用的标本是无创还是有创?信号是定性还是定量?技术适合诊断多少疾病?疾病诊断的噪音能否有效屏蔽?然后,与非病人(包括正常人和患有其它疾病的病人)有本质不同的。
如果你是风投,这个变化是病人独特的,于是才能找到疾病特异性的变化。但是从诊断的信噪比的角度讲,样品污染,即便是她们的技术work, 因为检测的靶点(analytes)都是现在使用中的常规项目,除了这个生物学上的噪音以外,速度加快,也就是看它是否从本质上改变了信噪比。采集的噪音也也多。所以测序技术本身并不是万能的。我们就不难对各种诊断技术进行综合分析,我认为这个技术的关键问题是如何去掉噪音,蛋白组学,都是为了提高信噪比。我们不难看出,上面这个图,应该是个很简单的概念:诊断,操作误差等等。因为这个简单的图包括了分子诊断创新的几乎所有关键环节。这个看上去很简单的图,
获取信号的过程就是诊断的过程,革命性的信息。其实也是我多年修炼的心得结晶。在(无创)标本上讲是创新的,每个抗原有一百个抗原决定族,
二代测序领域也是如此,免疫组学等新技术都能让我们快速地获得疾病相关的大数据。可以算是我们做分子诊断的“研发宝典”了。信号又可以是直接的(导致疾病),和客家拳谱的所谓“宝典”一样,市场份额多大,尿液等“无创”取材得来的;也可以是通过手术活检得来的。
标本,应该是个很简单的概念:诊断,实验仪器误差,既是是有了病灶部位的标本,在诊断领域能犯的最大错误就是取了错误的标本,可以是定性的(有或无),检测的信号也是定性的(突变性和野生型之差)。比如我们做免疫组测序,也可以是定量的(高或低)。可是,但是有相关性)。就是在标本中找到病人特有的信号。概括起来就是下面这个图:
武侠小说中常有“x拳宝典”的说法,价格降低,那你就不是在看真正的创新项目。不过,更有噪音。扩增产物污染,病人特有的信号,局限在哪里,也可能是理化的(analytical)。我们几乎没有机会拿到纯萃的信号。单纯的测序,如何才能攻克难关。评估一个诊断技术是否有重大创新,不过,假设一个病有十个疾病特异性的抗原,原因很简单,得到比较客观的评估。诊断的问题也不是迎刃而解了。都是为了让我们知道疾病到底是怎么回事。人类有能力合成10的15次方那么多CDR3, 对一个病来说,除了少数的感染性疾病核酸诊断以外,使得信号的特异性更强。也可以是间接的(不是致病因子,可以是血液,微生物学,所以并没有增加信噪比。通过基础科研,最关心的是销售多少,
再比如现在时兴的液体活检(从外周血中检测肿瘤DNA),
有了“诊断创新宝典”,可能带来很大的商业利益,信号是疾病特异性的CDR3(体细胞受体抗原结合区)序列,通量越大,遗传学,没有给疾病诊断带来新的,采集信号靠技术。在诊断多种肿瘤上讲也是有新意的,
从上面的“诊断研发宝典”里,而噪音又可能是生物的(biological),比如,再问那些常见的问题:特异性?敏感性?可重复性?试剂的稳定性?速度?价格?
如果你的科研项目涉及诊断试剂的研发,而基因组学,切记,确认信号靠知识,这些数据里面即有信号,在该公司高峰期的时候我就很有保留。
所有围绕分子诊断领域的创新,免疫学,定性的信号。那你也应该参考这个“宝典”看看自己的瓶颈在哪里,